但是无论怎样，他们的这种安排，都是在相互利用，只是本质有所区别。整个系列影片，与其说是阿仁哥和刘sir刘建明的争斗，倒不如说是韩琛和黄sir的恩恩怨怨。
韩琛本来是倪家的一个重要头目，最初他和黄sir的关系很微妙，虽然两个人的身份对立，但是两个人在私下里却有很多的交流，有点惺惺相惜的感觉。但是两个人的目的又各不单纯，黄sir希望通过了解韩琛，控制韩琛，而将倪家除掉，以达到维持社会秩序的目的。
而韩琛则对倪家忠心耿耿，他之所以和黄sir保持这种微妙的关系，则是他的生存法则，他希望这种微妙暧昧的关系，能够帮助他现在进行的事业。
而黄sir挑唆韩琛老婆mary，在他的教唆下，mary安排对自己态度比较暧昧的，韩琛安排在警队的卧底刘sir刘建明刺杀了倪坤。她希望倪坤死后，韩琛能够上位成为龙头，但是韩琛却依然表现的对倪家忠心耿耿，并帮助倪坤的儿子倪永孝顺利上位。
这个过程中，黄sir十分被动，本来他希望通过这个举动扶持韩琛成为老大，这样让尖沙咀的坏人更受自己的控制，让社会秩序得以恢复。但是因为韩琛蒙在鼓里，所以事情并没有朝着黄sir期望的方向发展。
黄sir的这个做法，最终也直接导致韩琛走上了一条不归路。韩琛这个精明的家伙，他本来有自己的家庭，他深爱着mary，他有自己的正常生活，这也是为什么他在那些人中，表现的更有人情味的原因。后来倪永孝发现了倪坤被害的原因，所以他策划了清算几个尖沙咀老大的行动，这里面也包括韩琛和mary。
虽然倪永孝也基本确定韩琛没有参与刺杀倪坤的行动，但是为了以绝后患，倪永孝不得不也将韩琛作为目标。在清算这几个老大的同时，倪永孝还巧妙的将他所掌握的证据提交给了警方，证据显示，刺杀倪坤的想法，是黄sir向mary提出的。
一时间，黄sir和韩琛都陷入了极为被动的局面，虽然后来两人都逃过了一劫，但是因为mary被杀，韩琛性情大变。虽然他答应了做警方的证人，但是在《无间道2》快要结束时，他利用黄sir杀死了倪永孝。
从此黄sir和韩琛成为了一对新的死对头。而从这个时候开始，才揭开了黄sir和韩琛相互利用自己的卧底资源进行斗争的剧情。这两个卧底角色的处境变化也很有深意，最初阿仁哥虽然只是倪坤的私生子，但是也注定了他的“血统”很难成为一名真正的阿sir。不过在面临一些列的考验之后，阿仁哥成功的从里到外地，成为了梦想中的差人。虽然他表面的身份一直是韩琛的手下。
而刘sir刘建明从最开始就对自己的身份充满了自卑感，他之所以追随韩琛，就是希望自己能够尽快的出人头地。后来虽然刘sir刘建明在警队层层高升，但是他依然没有摆脱自己内心的自卑感，因为在他的内心深处，他的真实身份一直是个坏人。
所以他到最后，也未能成为一个好人。有一件事情，也很好的表现了刘sir刘建明内心对自己的不自信。刘sir刘建明一直暗恋mary，当得知韩琛出事后，刘sir刘建明向mary表白，被mary拒绝后，刘sir刘建明竟然选择残忍的将mary置于死地。
在看似错综复杂的关系中，导演用清晰的故事脉络，向观众讲述了出来混，就要还的道理。这里面包括韩琛和黄sir，包括刘sir刘建明，当然这里面也有阿仁哥。
结合《无间道》系列的1、2部影片的故事来看，整个的故事开端，最主要的就是黄sir和韩琛两个人特殊的关系。两个人一个坏人和一个差人，保持着一种暧昧不清的关系，其实在两个人一起吃饭聊天的时候，本来就是一种相互卧底的过程，只是这个过程没有那么的明显，他们是通过自己的聊天行为完成的卧底目的。后来他们通过对这种聊天行为的深化，演变成了相互卧底的故事情节。
黄sir通过教唆mary杀死了倪坤，后来又在行动中，被韩琛利用枪杀了倪永孝。以至于黄sir最后自己也死于韩琛马仔的手上，他的报应也是出来混就要还的写照。
黄sir虽然目的是为了除恶扬善，但是他在处理这些事情时，所用到的手段，也是充满恶意的。他利用阿仁哥的特殊身份，让阿仁哥到倪家去卧底，他利用mary对韩琛的感情，教唆mary杀死韩琛的恩人倪坤，他在倪坤刚刚死后，去用激烈的言辞刺激倪永孝。虽然他是为了伸张正义，但是未免有点方法极端。以至于他最后被韩琛的马仔丢下天台，死于非命。
而阿仁哥虽然是一名差人，但是他同样也是倪家被灭门之后，倪家在这个世界上唯一的代言人，所以最后阿仁哥成功打入了韩琛的集团，因为他出色的工作，最后导致了韩琛被杀。这个过程中，很难说阿仁哥没有一点点私情，仔细的观众可以想一下《无间道2》倪永孝被杀时，他看着阿仁哥的眼神，难道那一刻阿仁哥没有一丝的触动？
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